在《Fairy gone》世界中，有着能将妖精作为兵器所操使的“妖精兵”存在。而在故事中，距离战争9年后那不稳定的政局，因战争受到伤害展开复仇的恐怖份子因此出现。过去故乡被战争毁灭的主角“玛莉亚诺耶尔

孝明年间，山河动荡，武林黑暗。隐姓埋名的侯府公子左卿辞，以江湖游医身份，在两月之期内，寻找一卷遗失的山河图，由此结识了易容盗贼飞寇儿。飞寇儿背景神秘，为给师父苏璇盗药不慎曝光身份，竟是正阳孽徒——苏云